Siccome dalla lettura della Bibbia, e di altri libri religiosi scritti nella sua lingua, aveva acquistato la cognizione della verità non mancò di comunicarla ai suoi vicini, e fu subito messo in prigione. Persuaso da suoi amici acquistò la libertà con una ritrattazione, che lo gettò in una grand'alterazione di mente. Ristabilito da quell'abbattimento di spirito, risolse di occuparsi, anche con maggior zelo di prima, a scoprire a suoi concittadini gli errori, nei quali erano indotti, e far loro conoscere la vera via della salvazione. A questo scopo viaggiò per la Romagna. Il suo piano era d'illuminare un picciol numero di persone, e di lasciare a queste l'incarico di istruire gli altri, mentre egli passava in altro luogo a fare altrettanto. Con questo metodo egli disseminò in breve tempo la dottrina evangelica. Ma alla fine fu arrestato a Bagnacavallo, e condotto in Ferrara fra le catene. Nè sollecitazioni, nè minacce poterono indurlo a vacillare nella sua confessione della verità. Alle lagrime, e alle querele della moglie, e della sorella, che andavano a vederlo in prigione, rispondeva: "Vi basti che per amor vostro ho una volta negato il mio Salvatore. Se avessi avuto la cognizione, che per grazia [309] di Dio ho acquistata dopo il mio fallo, non avrei ceduto alle vostre preghiere. Andate in pace, tornate a casa." Si può dire che la prigionia di Fannio, che durò due anni, accadesse opportuna "al soccorso del Vangelo; di modo che i suoi legami in Cristo furono manifesti a tutto il palazzo". Fu visitato dalla principessa Lavinia della Rovere, da Olimpia Morata, e da altre persone di riguardo, ch'erano edificate dalle sue istruzioni e preghiere, e presero molto interesse pel suo destino.